西元1999年，1顆不明的庞大「流星」墜降正在天球上。之後調查證實這其實是1艘中星人的宇宙船，之後天下的某些強國為了將其建復並彌補墜降時對天球環境所酿成的破壞（還得掩蓋失降這個中星船墜降的事實），而組成了統开当局。並由天球統开軍將其革新成為齐長1200公尺的超大型主力戰艦，定名為「馬克羅斯」（MACROSS，德文「大宇宙」之意）。其間人類卻也歷經統开派與反統开派國家陣營的分裂，正在綿延的爭戰中馬克羅斯的改建則仍旧持續著。直到10年後，正在馬克羅斯舉止正式起用下水典禮的當天，正在月球軌讲4里突然發現有大規模的時空跳躍反應。而此時馬客羅斯艦上的主炮竟自動發射，並擊中正在月球出現的中星艦隊觀測艦！事已至云云頓時成了趕鴨子上架，不把對圆惹毛才是怪事……於是統开軍只好展開接戰，並讓馬克羅斯降空啟航，以轉移敵圆看重。青年1條輝陰錯陽好的坐上了統开軍的戰機捲进戰鬥，並救起了1...